刘庆友（硕士生导师）

姓名：刘庆友

性别：男

职称：佛山科学技术学院 教授

个人荣誉：

2018年入选广西高等学校卓越学者；

2020年入选中组部“西部之光”人才项目；

教育与工作经历

教育经历：

(1) 2004-9至2007-7, 中科院北京基因组研究所, 遗传学, 博士, 导师: 于军

(2) 2001-9至2004-7, 广西大学, 动物遗传育种与繁殖, 硕士, 导师: 石德顺

(3) 1995-9至1999-7, 莱阳农学院, 畜牧学, 学士

科研与学术工作经历：

(1) 2011-12至现在, 广西大学, 动物科学技术学院, 研究员，博导

(2) 2007-7至2011-12, 广西大学, 动物科学技术学院, 助理研究员

(3) 2016-12至2020-4, 中国农科院深圳基因组研究所, 博士后, 导师: 钱前院士

(4) 2008-5至2010-5, 广西大学, 博士后, 导师: 石德顺研究员

主要研究内容和研究成果

联合应用基因组学、功能基因组学、宏基因组和代谢组等方法，揭示畜禽重要经济性状形成的多组学基础，通过基因组精准设计育种、关键有益菌群结构调控，提升畜禽生产力和产品品质。

近年来，在Nature Communication, National Science Review等期刊发表论文100余篇，入选ESI全球Top 1%高被引论文1篇。

教学与人才培养：

承担本科生《动物繁殖学》、硕士生《动物繁殖学》等课程。已培养博士后4名；毕业博士研究生8名。毕业硕士20名。博士毕业生3人为副教授职称。

社会兼职：

学术兼职：第五届全国畜牧学科高峰论坛副秘书长、中国畜牧兽医学会高级会员、国家农业基因组科技创新联盟理事、中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会理事、中国农业生物技术学会理事《基因组学与应用生物学》副主编、《黑龙江动物繁殖》常务编委、《Frontiers in Genetics》编委，广东省畜禽遗传资源委员会专业委员会委员。

主持科研项目情况：

1. 国家自然科学基金联合基金重点，U20A2051，水牛重要经济性状基因组学与功能基因组学研究，2021-1-1至2024-12-31，260万元，在研，主持。

2.国家自然科学基金地区基金，31860638，应用基因捕获高通量测序精准鉴定影响水牛产奶性状的关键基因研究，2019-1-1至2022-12-31，39万元，在研，主持。

3.广西科技厅，广西重点研发计划，桂科AB18221120，通过干预肠道微生物实现水牛生态养殖的关键技术研究，2018-10-1至2020-9-30，36万元，在研，主持。

4.广西教育厅，广西卓越学者团队，20180815，2018-08-15至2021-8-15,120万元（广西大学另外配套120万元），在研，主持。

5.广西科技厅，广西创新驱动发展专项，桂科AA17204051，意大利乳用水牛快速扩繁关键技术体系研究与集成应用，2017-9-1至2020-12-31，300万元，在研，子课题主持人（负责50万元）。

6.广西科技厅，广西重点研发计划，桂科AB16380042，高产意大利奶用水牛新品种引进与繁育技术研究，2016-9-1至2019-12-31，50万元，在研，主持 。

7. 国家科技部，863计划，2013AA102504-02，奶牛重要经济性状的功能基因组学研究—-水牛繁殖性状的功能基因组学研究，2013-1-1至2017-12-31，子课题主持人，负责经费155万元，结题完成。

8.国家自然科学基金委员会，国家自然科学基金，31260552，基于全外显子测序的水牛不同时期卵巢转录组研究，2013-1-1至2016-12-31，52万元，已结题，主持。

9.国家科技部，863计划，2011AA100607，新型动植物生物反应器创制，2011-4-9至2015-12-31，1145万元，在研，参加。主持人石德顺。

10.国家自然科学基金委员会，国家自然科学基金，30960251，水牛胎儿成纤维细胞诱导为多能干细胞的初步研究，2010-1-1至2012-12-31，23万元，已结题，主持。

11.国家教育部，高等学校博士点科研基金，无，水牛胎儿成纤维细胞诱导成多能干细胞（iPSCs）的初步研究，2009-3-10至2012-3-9，3.6万元，已结题，主持。

12.广西科技厅，广西自然科学基金，桂科自0991007Z，抗乳房炎转基因奶水牛和奶牛的研究，2009-3-1至2012-3-31，13万元，已结题，主持。

13.国家农业部，国家科技重大专项，2008ZX08007-003，高繁殖力和高产奶量的转基因水牛新品种培育，2008-7-1至2010-12-31，2681万元，已结题，子课题负责人。

发表论文：

1. Feng Tong*, Teng Wang*, Na L. Gao*, Ziying Liu, Kuiqing Cui, Yiqian Duan, Sicheng Wu, Yuhong Luo, Zhipeng Li, Chengjian Yang, Yixue Xu, Bo Lin, Liguo Yang, Alfredo Pauciullo, Deshun Shi, Guohua Hua#, Wei-Hua Chen#, Qingyou Liu#. The microbiome of the buffalo digestive tract. Nat Commun 13, 823 (2022).

2. Luo, X.; Zhou, Y.; Zhang, B.; Zhang, Y.; Wang, X.; Feng, T.; Li, Z.; Cui, K.; Wang, Z.; Luo, C.; Li, H.; Deng, Y.; Lu, F.; Han, J.; Miao, Y.; Mao, H.; Yi, X.; Ai, C.; Wu, S.; Li, A.; Wu, Z.; Zhuo, Z.; Da Giang, D.; Mitra, B.; Vahidi, M. F.; Mansoor, S.; Al-Bayatti, S. A.; Sari, E. M.; Gorkhali, N. A.; Prastowo, S.; Shafique, L.; Ye, G.; Qian, Q.; Chen, B.; Shi, D*.; Ruan, J*.; Liu, Q*. Understanding divergent domestication traits from the whole-genome sequencing of swamp and river buffalo populations. National Science Review. 2020;7：686-701. 37*/37 (并列通讯作者). SCI,Q1(IF：17.275). 

3. Li, Z.; Cui, K.; Wang, H.; Liu, F.; Huang, K.; Duan, Z.; Wang, F.; Shi, D*.; Liu, Q*.,. A milk-based self-assemble rotavirus VP6-ferritin nanoparticle vaccine elicited protection against the viral infection. Journal of nanobiotechnology. 2019, 17(1):13. 9*/9 (并列通讯作者). SCI,Q1 (IF：10.435). 

4. Cai, X.; Liu, Q*.; Zhang, X.; Ren, Y.; Lei, X.; Li, S.; Chen, Q.; Deng, K.; Wang, P.; Zhang, H.; Shi, D*. Identification and analysis of the expression of microRNA from lactating and nonlactating mammary glands of the Chinese swamp buffalo. Journal of dairy science. 2017,100(3):1971-1986. 2*/11（并列通讯作者）. Q1(IF：4.034).

5. Zhang, H.; Li, Y.; Cui, K.; Chen, X.; Shang, C.; Min, W.; Jin, P.; Jiang, Z.; Shi, D.; Liu, Q*.; Wang, F*. Male fertility in Mus musculus requires the activity of TRYX5 in sperm migration into the oviduct. Cell. Physiol. 2020 ;235(9):6058-6072. 10*/11(并列通讯作者). SCI,Q2(6.389)

6. Ahmed I, Rehman SU, Shahmohamadnejad S, Zia MA, Ahmad M, Saeed MM, Akram Z, Iqbal HMN, Liu Q*. Therapeutic Attributes of Endocannabinoid System against Neuro-Inflammatory Autoimmune Disorders. Molecules. 2021 Jun 3;26(11):3389. doi: 10.3390/molecules26113389. SCI,Q2(4.411)

7. Muhammad Saif-ur Rehman†, Saif ur Rehman†, Wasim Yousaf, Faiz-ul Hassan ,Waqas Ahmad, Qingyou Liu* and Hongping Pan*, The Potential of Toll-Like Receptors to Modulate Avian Immune System: Exploring the Effects of Genetic Variants and Phytonutrients, August 2021 | Volume 12 | Article 671235 SCI,Q2(4.599).

8. Rehman SU, Feng T, Wu S, Luo X, Lei A, Luobu B, Hassan FU, Liu Q*. Comparative Genomics, Evolutionary and Gene Regulatory Regions Analysis of Casein Gene Family in Bubalus bubalis. Front Genet. 2021 Mar 23;12:662609. doi: 10.3389/fgene.2021.662609. SCI,Q2(4.599).

9. Yang, C.; Zheng, H.; Moussa, M.; Amin, A.; Huang, J.; El-Sayed, A.; Shang, J.; Liu, Q*. Effects of laser zona thinning and artificial blastocoel collapse on the cryosurviving and hatching of buffalo (Bubalus bulalis) blastocysts of different ages. Theriogenology. 2020;147:197-201. 8*/8（通讯作者）. SCI,Q2(2.74）

10. Shi W, Yuan X, Cui K, Li H, Fu P, Rehman SU, Shi D, Liu Q*, Li Z. LC-MS/MS Based Metabolomics Reveal Candidate Biomarkers and Metabolic Changes in Different Buffalo Species. Animals (Basel). 2021 Feb 20;11(2):560. doi: 10.3390/ani11020560.  SCI,Q2(2.752）

11.  Shafique L, Abdel-Latif HMR, Hassan FU, Alagawany M, Naiel MAE, Dawood MAO, Yilmaz S, Liu Q. The Feasibility of Using Yellow Mealworms (Tenebrio molitor): Towards a Sustainable Aquafeed Industry. Animals (Basel). 2021 Mar 13;11(3):811. doi: 10.3390/ani11030811. SCI,Q2(2.752）

12.  Rehman SU, Hassan FU, Luo X, Li Z, Liu Q. Whole-Genome Sequencing and Characterization of Buffalo Genetic Resources: Recent Advances and Future Challenges. Animals (Basel). 2021 Mar 22;11(3):904. doi: 10.3390/ani11030904. SCI,Q2(2.752）

13. Xiao, N.; Li, H.; Shafique, L.; Zhao, S.; Su, X.; Zhang, Y.; Cui, K.; Liu, Q*.; Shi, D*.,. A Novel Pale-Yellow Coat Color of Rabbits Generated via MC1R Mutation With CRISPR/Cas9 System. Frontiers in genetics. 2019;10:875. 8*/9 (并列通讯作者). SCI,Q2(4.599).

14. Lei, X.; Cui, K.; Li, Z.; Su, J.; Jiang, J.; Zhang, H.; Liu, Q*.; Shi, D. BMP-1 participates in the selection and dominance of buffalo follicles by regulating the proliferation and apoptosis of granulosa cells. Theriogenology. 2016;85(5):999-1012. 7*/8 (通讯作者). SCI,Q2(2.74). 

15. Sun J, Liu Q†, Lv L, Sun R, Li ZP, Huang B, Cui K, Shi D. HDAC6 Is Involved in the Histone Deacetylation of In Vitro Maturation Oocytes and the Reprogramming of Nuclear Transplantation in Pig. Reprod Sci. 2021 Sep;28(9):2630-2640. doi: 10.1007/s43032-021-00533-2. SCI,Q2(3.062).

16. Rehman S U, Nadeem A, Javed M, Hassan F U, Luo X, Khalid R B, Liu Q. 2020. Genomic Identification, Evolution and Sequence Analysis of the Heat-Shock Protein Gene Family in Buffalo[J]. Genes (Basel), 11(11). (通讯作者) SCI,Q2(4.092).

17. Shafique L, Wu S, Aqib AI, Ali MM, Ijaz M, Naseer MA, Sarwar Z, Ahmed R, Saleem A, Qudratullah, Ahmad AS, Pan H, Liu Q*. Evidence-Based Tracking of MDR E. coli from Bovine Endometritis and Its Elimination by Effective Novel Therapeutics. Antibiotics (Basel). 2021 Aug 18;10(8):997. doi: 10.3390/antibiotics10080997. SCI,Q3(4.639).

18. Zhong D, Chen M, Zhang L, Chen H, Shi D, Liu Q, Li H. Aberrant regulation of RNA methylation during spermatogenesis. Reprod Domest Anim. 2021 Jan;56(1):3-11. doi: 10.1111/rda.13856. Epub 2020 Dec 1. PMID: 33174242.

19. Li, H.; Huang, K.; Wang, P.; Feng, T.; Shi, D.; Cui, K.; Luo, C.; Shafique, L.; Qian, Q.; Ruan, J.; Liu, Q*. Comparison of Long Non-coding RNA Expression Profiles of Cattle and Buffalo Differing in Muscle Characteristics. Frontiers in Genetics. 2020;11:98. 11*/11 (通讯作者). Q3(3.258)

20. Rehman SU, Shafique L, Ihsan A*, Liu, Q*. Evolutionary Trajectory for the Emergence of Novel Coronavirus SARS-CoV-2. Pathogens. 2020;9(3):240. 4*/4 (并列通讯作者). SCI,Q3(3.018).

21. Li Z, Lu S, Cui K, Shafique L, Rehman SU, Luo C, Wang Z, Ruan J, Qian Q, Liu Q*. Fatty acid biosynthesis and transcriptional regulation of Stearoyl-CoA Desaturase 1 (SCD1) in buffalo milk. BMC Genet. 2020;21(1):23. 10*/10（通讯作者）. SCI,Q3(2.567)

22. Lv, L.; Lu, X.; Feng, T.; Rehman, S. U.; Wu, Z, Liu, Q*; Cui, K*, Valproic acid enhances in vitro developmental competence of porcine handmade cloned embryos. Livestock Science. 2020;233;103957. 8*/9 (并列通讯作者). SCI,Q3(1.7）.

23. Lei X*, Cui K*, Liu Q*, Zhang H, Li Z, Huang B, Shi D. Exogenous Estradiol Benzoate Induces Spermatogenesis Disorder through Influencing Apoptosis and Oestrogen Receptor Signalling Pathway. Reproduction in domestic animals. 2016;51(1):75-84. 3*/7 (并列第一作者). SCI,Q3(1.4)..

24. Li L Y, Li M M, Yang S F, Zhang J, Li Z, Zhang H, Zhu L, Zhu X, Verma V, Liu Q, Shi D, Huang B. Inhibition of FGF Signalling Pathway Augments the Expression of Pluripotency and Trophoblast Lineage Marker Genes in Porcine Parthenogenetic Blastocyst. Reproduction in domestic animals. 2016, 51(5):649-656. 本人排名10/12. SCI,Q3(1.4). (并列通讯作者)

25. Sun JM, Cui KQ, Li ZP, Lu XR, Xu ZF, Liu QY, Huang B, Shi DS. Suberoylanilide hydroxamic acid, a novel histone deacetylase inhibitor, improves the development and acetylation level of miniature porcine handmade cloning embryos. Reprod. Domest. Anim. 2017,52(5):763-774. 本人排名6/8. SCI,Q3(1.422). (并列通讯作者)

26. Sun J, Cui K, Li ZP, Gao B, Huang B, Liu, Q*, Shi D*. Improved early development potence of in vitro fertilization embryos by treatment with tubacin increasing acetylated tubulin of matured porcine oocytes. Mech Dev. 2020;103631. 6*/7（并列通讯作者）. SCI,Q4(2.126).

27. Feng, T.; Zhang, Z.; Qu, M.; Luo, C.; Laiba; Shafique; Liu, Q*,Cui, K*. Three SNPs Identified in the MC1R Gene of Nubian Goats may Relate to the Wool Color. Pakistan Journal of Zoology. 2020;52(3):843-847. 6*/7 (并列通讯作者). SCI,Q4(0.790).

28. Liu, J.; Cao, Y.; Feng, T.; Shafique, L.; Luo, C; Zhu, Z*; Liu, Q*., Expression Patterns of BMP15 Gene in Folliculogenesis of Buffalo (Bubalus bubalis). Pakistan Journal of Zoology. 2020;52(1):37-47. 7*/7 (并列通讯作者). SCI,Q4(0.790). 

29. Li, H.; Li, Z.; Xiao, N.; Su, X.; Zhao, S.; Zhang, Y.; Cui, K.; Liu, Q*.; Shi, D*. Site-specific integration of rotavirus VP6 gene in rabbit β-casein locus by CRISPR/Cas9 system. In vitro cellular & developmental biology. Animal. 2019;55(8):586-597. 8*/9 (并列通讯作者). SCI,Q4(1.665)

30. Li, Z.; Cui, K.; Huang, K.; Liu, F.; Shi, D*.; Liu, Q*. Self-assembling Rotavirus VP6 Nanoparticle Vaccines Expressed in Escherichia coli Elicit Systemic and Mucosal Responses in Mice. Protein and peptide letters. 2019;26(12):904-909. 6*/6(并列通讯作者). CI,Q4(1.156). 

31. Le J, Lei X, Ren Y, Li Z, Tu H, Ding F, Yi X, Zhou Y, Liu, Q*, Zhang S*. Exogenous oestradiol benzoate induces male mice azoospermia through modulation of oxidative stress and testicular metabolic cooperation. Molecular Medicine Reports. 2019;19(6):4955-4963. 9*/10 (并列通讯作者). SCI,Q4(2.1)

32. Liu,J; Cao,Y; Wu, Z; Shafique, L; Chen, S; Xuan, Z; Feng, T; Luo, C; Zhu,P*; Liu, Q*. Molecular Cloning and Expression Patterns Study of Growth Differentiation Factor 9 Gene (GDF9) in Water Buffalo (Bubalus bubalis). Intl. J. Agric. Biol. 2019, 22: 1010‒1016. 10*/10 (并列通信作者). SCI,Q4(0.87).

33. Su, X.; Cui, K.; Du S; Li, H.; Lu, F.; Shi, D*.; Liu, Q*. Efficient genome editing in cultured cells and embryos of Debao pig and swamp buffalo using the CRISPR/Cas9 system. In Vitro Cellular & Developmental Biology – Animal. 2018;54(5):375-383. 7*/7 (并列通讯作者). SCI,Q4(1.665). 

34. Lei X, Cui K, Cai X, Ren Y, Liu Q*, Shi D*. Bone morphogenetic protein 1 is expressed in porcine ovarian follicles and promotes oocyte maturation and early embryonic development. Journal of Veterinary Medical Science. 2017;79(2):258-266. 5*/6(并列通讯作者). SCI,Q4(1.049) 

35. Zhang Xiaoxi, Zheng Haixue, Xu Minjun, Zhou Yu, Li Xiangping,Yang Fan, Liu Qingyou*, Shi Deshun*. Evaluation of a combinatorial RNAi lentivirus vector targeting foot-and-mouth disease virus in vitro and in vivo. Molecular medicine reports. 2015;12(5):6672-6678. 7*/8 (并列通讯作者). SCI,Q4(1.559). 

36. Shafique L, Afzal M, Shah S Z H, Fatima M, Liu Q. 2019. Dietary Formic Acid and Vitamin D3 as Growth Effective Supplement for Grass Carp Fingerlings[J]. Pakistan Journal of Zoology, 51(6): 1-4. (通讯作者)

国内核心

37. 李辉,陈明棠,刘超,谭正准,黄健,李忠权,赵宏涛,石德顺,刘庆友*.意大利地中海奶水牛引种观察初报. 中国畜牧杂志. 2018,54(02):104-107–133. 9*/9（通讯作者）. CSCD. 他引次数1.

38. 赵珊珊,肖宁,李志鹏,潘庆杰,李桢,石德顺,刘庆友*.马MC1R基因多态位点与毛色相关性分析. 畜牧兽医学报. 2018,49(08):1605-1616. 7*/7（通讯作者）. CSCD. 他引次数2.

39. 李志鹏,刘福航,崔奎青,石德顺,刘庆友*.铁蛋白Ferritin原核表达和纯化及纳米颗粒胞外自组装. 畜牧兽医学报. 2018,49(01):75-82. 5*/5（通讯作者）. CSCD. 他引次数2.

40. 蔡小艳,王鹏程,邓凯,王萍,冯万有,张晓溪,任艳萍,刘庆友*,石德顺*.水牛泌乳期与非泌乳期乳腺组织差异miRNAs的表达模式鉴定及分析. 中国畜牧兽医. 2017,44(11):3220-3228. 8*/9（并列通讯作者）. CSCD. 他引次数1.

41. 蔡小艳,鲍正攀,古景开,邓凯,张晓溪,任艳萍,沈朋雷,石德顺*,刘庆友*.水牛泌乳期与非泌乳期乳腺组织miRNAs表达谱鉴定及差异表达分析. 畜牧兽医学报. 2017,48(09):1635-1647. 9*/9（并列通讯作者）. CSCD. 

42. 蔡小艳,李胜,陈秋萍,王萍,邓凯,刘庆友*,石德顺*.水牛bbu-miR-103-1在泌乳期与非泌乳期表达模式及靶向基因的初步研究. 畜牧兽医学报. 2016,47(11). 6*/7（并列通讯作者）. CSCD. 

43. 粟小平,肖宁,罗西尔,雷薇,崔奎青,石德顺*,刘庆友*.水牛MBD3基因克隆分析及其真核表达载体的构建. 中国畜牧兽医. 2016,43(08):1951-1959. 7*/7（并列通讯作者）. CSCD. 

44. 侯策,粟小平,王起恬,崔奎青,石德顺,刘庆友.关中奶山羊PIS区域序列多态性分析[J].中国畜牧兽医,2017,44(12):3554-3562.

45. 陈秋萍,徐生祥,刘庆友,石德顺.脯氨酸对母猪繁殖性能影响的研究进展[J].中国畜牧兽医,2017,44(03):767-772.

46. 李俊,许钟峯,张海航,尚月丽,孔祥峰,石德顺,刘庆友.环江香猪黏附素13基因多态性及其与仔猪腹泻的相关性分析[J].中国畜牧兽医,2016,43(07):1818-1825.

47. 黄孔威,李志鹏,崔奎青,石德顺,刘庆友.重组水蛭素的原核表达及分离纯化[J].中国畜牧兽医,2018,45(01):1-13.

48. 秦科,陈炜,王美霞,陈丽卿,刘慧君,史亚,刘庆友,石德顺,陈欢.铁皮枫斗晶对人肠道微生物的影响[J].中华中医药杂志,2020,35(04):1718-1723.

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